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1. γ 射线或χ 射线
χ射线、γ射线等电离辐射带有较高的能量，能引起被照射物质中原子的电离，导致突变。射线照射会导致染色体大片段的缺失或染色体的重排，产生的突变率高达1%，但由于其突变常累及多个基因，突变的表型通常是若干个基因功能改变的结果，不利于致突变基因的功能分析。
2. 化学突变
目前公认的最有效的和应用最多的是烷化剂和叠氮化物两类。烷化剂是指具有烷化功能的化合物，带有一个或多个活性烷基，该活性烷基可置换DNA碱基中的氧原子，碱基被烷化后，DNA在复制时会导致配对错误，产生突变。叠氮化物是一种动植物的呼吸抑制剂，它可以使复制中的DNA的碱基发生替换，从而导致突变发生，是诱变率高而安全的一种诱变剂。其中以叠氮化钠使用较多。
3. 插入突变
插入突变是指通过人为操作使核苷酸或基因导入到靶基因中，导致靶基因发生突变而功能缺失的突变方法。包括：
（1）DNA 注射法
（2）反转录病毒转染
（3）转座子插入突变
（4） Gene trap 插入突变
4. 转座子插入突变
1983年诺贝尔医学与生理学奖获得者McClintock 在20世纪50年代提出转座子模型。? 在酵母、果蝇和哺乳动物中都发现了转座因子的存在。转座子可以通过切割与粘接使自己从原来的位点发生解离并且在靶DNA的其他位点插入，这个插入的过程是随机的。转座因子可以高效地插入DNA中，它不仅可以通过插入突变引起内源基因的突变，同时也可以进行转基因作用将外源基因导入从而引起新的表型。
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